Ко второму сеансу практики температура трассы поднялась до 26 градусов. Некоторые пилоты покинули боксы сразу после того, как загорелись зеленые огни светофора. В числе первых оказались и лидеры - Мика Хаккинен, Дэвид Култхард, а с небольшим запозданием их примеру последовал и Михаэль Шумахер. Шумахер был очень быстр, он еще улучшил свое время, показанное в первом сеансе - 1’37"999. Мика Хаккинен также оказался быстрее, чем утром, но он на три с лишним десятых секунды медленнее немца.

Пилот Джордана Хайнц-Харальд Френтцен поднимается на третье место, в то время, как Мика Хаккинен все еще пытается обогнать своего конкурента. На первых двух секторах он немного быстрее, однако затем финн пропускает шикану и на этом его попытка завершается.

Михаэль Шумахер вновь появляется на трассе. Он предельно собран и очень быстр - 1’37"728, уже на шесть десятых быстрее Хаккинена. Дэвид Култхард сумел потеснить Френтцена с третьего места, а Баррикелло обосновался на пятом. Жана Алези разворачивает в шикане, однако он остается на трассе. Эдди Ирвайн становится шестым, отставая от Баррикелло.

Дженсон Баттон поднимается на девятое место, а в это время на очередные попытки отправляются Рубенс Баррикелло и Дэвид Култхард. Шотландец остается на третьем месте, отстав от Шумахера на 1,3 секунды. Тем временем “вечно последний” Гастон Маццакане вновь сталкивается с проблемами, и на этом практика для него окончена.

Култхард немного улучшает свое время, но его обгоняет Рубенс Баррикелло - 1’38"537. Шумахер также на трассе. Ярно Трулли опережает своего партнера и становится пятым, а в это время Мика Хаккинен вновь выезжает из боксов, чтобы попробовать отобрать у Шумахера лучший круг и некоторое психологическое преимущество. Вскоре на трассу отправляется и второй Макларен Дэвида Култхарда. Пилоты БАР’а Рикардо Зонта и Жак Вильнев находятся соответственно на седьмом и четырнадцатом местах, Диниц поднимается на десятое.

Однако ни один из пилотов Макларена не смог улучшить свое время, и они оба возвращаются в боксы. Жан Алези едет очень медленно - у его Проста вновь возникли какие-то проблемы с двигателем. Позиция Шумахера выглядит неприступной, но через десять минут обе Феррари вновь выруливают на трассу. В это время Жак Вильнев теснит с седьмого места своего партнера.

Ник Хайдфельд поднимается на пятнадцатое место, сегодня он прошел больше всех кругов - 33. Хотя Шумахер и Хаккинен пытаются пройти круг еще быстрее, у них этого не получается, да и другие пилоты сохраняют свои позиции. Лишь Педро Де Ла Роса улучшает свое время и становится седьмым, да Дженсон Баттон перемещается на пятую позицию - очередной отличный дебют молодого англичанина. Уже в конце второго сеанса практики в Японии произошло землетрясение. В его эпицентре мощность достигала 7,1 балла по шкале Рихтера. Однако это не остановило Шумахера, который в это время проходил быстрый круг.

Первая шестерка по результатам практики выглядит следующим образом: Михаэль Шумахер, Мика Хаккинен, Рубенс Баррикелло, Дэвид Култхард, Дженсон Баттон и Ярно Трулли.